国家葡萄葡萄酒产业网
现代农业产业技术体系管理平台
网站总访问量:10214163人
设为首页|收藏本站
会议信息
网站广告
葡萄病毒A在植株中的含量变化规律 [2020/2/12 10:45:01] 来源: 作者:Admin

病毒病防控岗位

任芳 董雅凤 范旭东 张尊平 胡国君

 

 

  葡萄病毒A G r a p e v i n ev i r u s A G VA ) 为线性病毒科(F l e x i v i r i d a e ) 葡萄病毒属(Vitivirus )的代表种,是葡萄皱木复合病(Rugose wood complexdisease)的重要病原之一,可引起葡萄嫁接成活率下降、春季萌芽延迟、生长减弱甚至衰退死亡。GVA在我国和世界各葡萄产区普遍发生。我国农业行业标准《葡萄无病毒母本树和苗木》(NY/T1843-2010)中规定无病毒母本树和苗木不得携带GVA,因此,建立该病毒的快速、准确检测方法十分必要。目前GVA常用快速检测方法为ELISART-PCR,但采用上述2种方法检测带毒植株嫩叶,很难检测到GVA,为此,本实验室研发了更加灵敏、高效的实时荧光定量RTPCRRT-qPCR)检测方法,并采用此方法对GVA在葡萄植株不同时期和不同组织部位中的相对含量进行测定分析,以明确该病毒在葡萄体内的分布规律和季节动态,为检测样品的采集时间和组织部位选择提供依据,从而提高葡萄病毒A的检测灵敏度和可靠性。


  1 材料与方法


  于2018678910月分别采集感染GVA葡萄植株上部嫩叶、嫩叶柄、下部老叶、老叶柄、卷须和枝条6个部位样品,11月份采集休眠枝条样品作为待测样本。采用改良吸附柱法提取总RNA,每个部位取3份样品混合后提取总RNA,采用去除基因组DNA反转录试剂盒(PrimeScriptTM RT reagentKit with gDNA EraserTakara)进行去DNA处理及反转录:取5×gDNA Eraser buffer 2.0μLgDNAEraser 1.0μL,总RNA 1.0μL混匀,42.02min;加入以下混合液:PrimeScript RT Enzyme Mix1.0μLRT Primer Mix 1.0μL5×PrimeScript buffer 2 4.0μLRNase Free dH2O 4.0μL3715min855s,合成cDNA放置于–20 ℃保存备用。


  以GVA目的基因引物QA2F/2R和葡萄内参基因GAPDH-F/REF1α-F/R引物,采用GVA RTqPCR方法对样品进行相对定量分析。反应在实时荧光定量PCR仪(美国BIO-RAD CFX ConnectTMReal-Time System)中进行,反应体系25μL,包含:2×SYBRGreenqPCR Mix 12.5μL1 0 μ m o l L - 1 正、反向引物各0.5μLDNase/RNase Free dH2O10.5μL cDNA 1μL。反应条件:95℃预变性3min9515s6015s7220s40个循环,在延伸步骤记录荧光信号。熔解曲线分析温度范围从60 ~ 95 ℃,其中每5 s 增加温度0.5 ℃,用于鉴别引物二聚体和非特异性扩增。RT-qPCR扩增时每板均添加GAPDH-F/REF1α-F/R作内参基因从而对定量分析结果进行校正,以GVA阳性样品cDNA稀释50倍为阳性对照,以健康葡萄植株样品为阴性对照。定量分析时以阳性对照表达量为1,利用Bio-Rad CFX Manager软件进行多板合并分析,确定每个待测样品中GVA相对含量。


  2 结果与分析


  对6 ~ 1 0 月葡萄不同时期上部嫩叶、嫩叶柄、下部老叶、老叶柄、卷须和枝条,以及11月休眠枝条等样品中GVA的相对含量测定结果表明,该病毒在寄主不同组织部位间分布不均匀,在生长季中随着季节变换浓度变化较大。不同组织部位间比较,枝条和老叶柄中病毒浓度最高,其次为老叶。枝条中的葡萄病毒A浓度6月最低,随后开始逐渐升高,8月到达最高,随后浓度略有降低。老叶柄中葡萄病毒A浓度随着时间推移逐渐升高,10月到达最高,高于同时期枝条中的浓度水平。从6月开始老叶中葡萄病毒A浓度随着植株生长逐渐升高,8月到达最高,随后逐渐降低,到10月浓度与6月基本持平,呈正态分布。




  嫩叶柄和卷须中葡萄病毒A浓度在早期(6~8月)很低,到秋季9~10月浓度明显升高至中等水平,嫩叶中葡萄病毒A浓度最低,在整个生长季中均难以达到检测水平(图1)。


  总体来讲,葡萄植株幼嫩组织部位中GVA病毒较低,特别是嫩叶中,几乎难以达到检测水平。成熟组织部位中病毒浓度普遍较高。在生长季早期,植株体内GVA浓度较低,随着季节变化浓度逐渐升高,到秋季后病毒在植株体内各部位间分布更为均衡(图2)。因此,在病毒检测时,尽可能选择夏秋季及以后的成熟组织材料,特别是老叶柄和枝条材料为最佳,其中病毒浓度较高,检测准确度更高;嫩叶中GVA浓度在整个生长季均很低,难以达到检测水平,不适合作为病毒检测材料。