无核种质材料创制岗位
徐炎 王跃进 张朝红 刘国甜
优系叶片样品采集,需选健康生长无病虫害、具代表性的植株,选取中上部成熟叶片,避开边缘、病斑处,于生长旺季的上午或傍晚采集,采集后分装到2.0mLEP管中,多准备30%-50%作为备份,标记分类好的叶片立刻在液氮中进行速冻,然后放入-80℃,进行DNA提取,-20℃冰箱保存备用。葡萄双亲SSR核心引物筛选:使用实验室前期验证的57对引物对父母本进行PCR反应,每对引物至少重复3次。初步筛选出父母本具有差异、多态性好、带型清晰的特异性引物。
聚丙烯酰胺凝胶电泳(8%非变性):(1)制胶:用自来水将玻璃板清洗干净,晾干备用,使用前必须是干燥状态;装玻璃板,短板在下,长板在上,短板插入胶条槽子中;底胶封口:50mL蒸馏水+1g琼脂使用微波炉加热,加热至澄清透明状态,沿着胶条缝隙倒均匀,竖着放使底胶凝固,大约10min;所配制的总体积为50mL:分别包括10%过硫酸铵500μL、13.5mL30%制胶液、5mL10×TBE(或者10mL5×TBE)、31.5mL蒸馏水、50μLTEMED(最后加入),所需试剂具体配方如表2-4,迅速摇匀后,立即灌胶至溢出,取出塑料盘梳子,从低板子处插入梳子,注意灌胶时不要有气泡产生,产生气泡应重新灌胶,插完梳子把板子平放在台面上凝固1h以上。(2)放置胶板:胶凝固后,用小刀刮除板子外的溢胶,连同胶条一起安装在电泳槽上(长板朝外),拧好螺丝,在电泳槽里加入一定量的1×TBE缓冲液,看看缓冲液是否有漏液的情况,如有漏液检查是否拧好螺丝了,加到电泳槽中的缓冲液的高度要超过点样孔,电泳槽两端的电泳缓冲液的高度要超过电阻丝的高度。(3)点样:梳子垂直拔出,拔完梳子之后,玻璃板附近有多余的废胶要清理掉,要保证点样孔里没有气泡,如果有气泡用枪头清理掉。点样时每个点样孔里加入0.5μL~2μLPCR扩增产物,在胶的第一个点样孔里加入DNAMarker(100-700bp)。如果DNA样品过多,为了避免所用枪头过多,可以用卫生纸对枪头进行擦拭,确保枪头里没有残留的PCR样品,该枪头可以继续使用。(4)电泳:在100W恒功率、220V恒电压、480mA下电泳45-60mim,具体时间可根据实际情况进行调整,DNAMarker(100-700bp)跑到胶板的2/3处时立刻结束电泳,防止跑过。(5)取胶:停止电泳后,1×TBE缓冲液倒进回收桶,此缓冲液可以重复使用。之后把螺丝拧开取出胶板,胶条取下,用小刀缓慢把两块长短胶板分开,将胶取下,放入提前装有蒸馏水的托盘中,轻轻用蒸馏水清洗胶,把蒸馏水倒掉,下一步银染。(6)染色:加入提前配制好的0.1%硝酸银溶液使用转速为30rpm的摇床染色15min左右,注意染色时间不要过久。(7)漂洗:把染色液倒掉(1L染色液可以染6-8块胶左右,根据实际情况决定染色液倒进废液桶或者回收桶),之后加入蒸馏水清洗胶3次左右,每次清洗的时间约30s,要确保把硝酸银清洗干净,如果清洗不干净会影响后续实验,清洗干净后进行下一步试验。(8)显色:在放有胶的托盘中加入提前配制好的显影液(1L蒸馏水+4mL甲醛),之后迅速放到摇床上,使用转速为30rpm的摇床显色3-5min左右,注意不要时间太久,显色完成后,把显色液倒掉,根据实际情况决定显色液倒进废液桶或者回收桶。(9)洗涤:加入蒸馏水将胶清洗3次左右,把显影液清洗干净。(10)保存:将胶放到胶片观察灯下进行观察,用提前准备好的滤纸吸干胶上的水分,以防拍照时反光,并把胶上的气泡赶出,之后进行拍照记录。