病毒病防控岗位
葡萄是携带病毒最多的果树。目前,国际上已报道90种侵染葡萄的病毒,中国已报道23种。不同类型的病毒,其基因组结构存在各自的特点。
葡萄卷叶相关病毒1(grapevine leafroll-associated virus, GLRaV-1)隶属长线型病毒科(Closteroviridae)葡萄卷叶病毒属(Ampelovirus),病毒粒子丝状,长约2000nm,病毒核酸为单链正义RNA(+ssRNA),已报道澳大利亚分离物长12394nt,基因组包含9个开放阅读框(open reading frame,ORF),分别编码7kDa小跨膜蛋白、热休克蛋白70、热休克蛋白90类似蛋白、外壳蛋白(CP)、两个不同拷贝的外壳蛋白(CPd1和CPd2)和其他两个功能未知的21kDa、24kDa蛋白。GLRaV-2隶属长线型病毒科(Closteroviridae)长线形病毒属(Closterovirus)病毒,核酸为+ssRNA,基因全长16494nt,含有9个ORFs。GLRaV-3隶属长线型病毒科(Closteroviridae)葡萄卷叶病毒属(Ampelovirus)病毒,核酸为+ssRNA,长18498nt,病毒基因组含有12个ORFs,具有510~802nt的5'UTR和259~277nt的3'UTR,与葡萄卷叶病毒属其他成员类似,都有一段保守区域。GLRaV-4隶属长线型病毒科(Closteroviridae)葡萄卷叶病毒属(Ampelovirus),病毒核酸为+ssRNA,长13830nt,病毒基因组含有7个ORFs,ORF1a、b编码的蛋白与病毒遗传有关,ORF2编码的蛋白参与病毒在细胞间的运动,ORF3编码的Hsp70蛋白是长线形病毒科下病毒的特征蛋白,ORF4编码的蛋白参与病毒组装和运动,ORF5编码病毒外壳蛋白,ORF6编码的蛋白功能尚不确定。GLRaV-7隶属长线型病毒科(Closteroviridae)丝状病毒属(Velarivirus),病毒核酸为+ssRNA,阿尔巴尼亚分离物长16404nt、瑞士分离物长16496nt,分别含有11个ORFs和9个ORFs,前者比后者多编码两个4kDa疏水蛋白和一种10kDa的蛋白。GLRaV-13隶属长线型病毒科(Closteroviridae)葡萄卷叶病毒属(Ampelovirus),病毒核酸为+ssRNA,基因全长17608nt,包含11个ORFs。
葡萄病毒属相关病毒(grapevine associated virus, GVA、GVB和GVE)均隶属乙型线性病毒科(Betaflexiviridae)葡萄病毒属(Vitivirus),病毒核酸均为+ssRNA,全长7.4~7.6kb,病毒颗粒长约700nm,直径12nm。GVA是萄病毒属的代表种,基因组有5个ORFs,5`和3`非翻译区(UTR)大小为86nt和68nt,3`端有Ploy(A)尾巴。ORF1编码大小195.5kDa的蛋白质,参与复制和酶修复功能,ORF2是葡萄病毒属特有的,编码一个19.8kDa的蛋白,ORF3和ORF4分别编码运动蛋白(MP)和外壳蛋白(CP),ORF5编码一个10kDa RNA结合蛋白。
葡萄浆果内坏死病毒(grapevine berry inner necrosis virus, GINV)和葡萄灰比诺病毒(grapevine pinot gris virus, GPGV)均隶属于乙型线性病毒科(Betaflexiviridae)纤毛病毒属(Trichovirus)。GINV和GPGV核酸均为+ssRNA,病毒颗粒为丝状,全长分别为7241nt和7259nt。GINV与GPGV在系统发育上属同一个分支,基因组均含有三个ORFs,ORF1编码病毒复制相关酶,ORF2编码运动蛋白,ORF3编码外壳蛋白。氨基酸水平上的同源性分别为66%(ORF1)、65%(ORF2)和71%(ORF3)。
西拉葡萄病毒(grapevine Syrah virus 1,GSyV-1)、葡萄静脉羽化病毒(grapevine rupestris vein feathering virus,GRVFV)、葡萄红地球病毒(grapevine redglobe virus,GRGV)和葡萄斑点病毒(grapevine fleck virus,GFkV)均属于芜菁黄花花叶病毒科(Tymoviridae),GSyV-1和GRVFV属马拉夫病毒属(Marafivirus),GRGV和GFkV属黄斑病毒属(Maculavirus)GSyV-1、GRVFV、GRGV和GFkV的基因组分别含有2个ORFs、1个ORFs、3个ORFs和4个ORFs,四种病毒基因组虽然在结构上存在差异,但它们都有一些共同的特征,即病毒核酸为+ssRNA,3`端有Poly A结构,5`端帽子结构封闭,富含胞嘧啶核苷(超过核苷酸含量的40%),先表达一个大的前体多蛋白,然后翻译成几个成熟蛋白后表达,这些成熟蛋白参与病毒复制和合成外壳蛋白。
葡萄扇叶病毒(grapevine fanleaf virus,GFLV)和葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus,GFabV)均属伴生豇豆病毒科(Secoviridae),分属线虫传多面体病毒属(Nepovirus)和蚕豆萎蔫病毒属(Fabavirus)。病毒基因组都是由两个+ssRNA组成,GFLV的 RNA-1分子大小为7330~7336nt,含有一个编码约250kDa多肽的ORF;RNA-2分子大小为3707~3852nt,包含一个编码多肽的ORF。