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无核胚挽救亲本分子标记核心筛选 [2024/10/15 15:20:55] 来源: 作者:Admin

无核种质材料创制岗位

徐炎 王跃进 张朝红 刘国甜

 

  选用40对葡萄特异性SSR引物对无核胚挽救杂交组合的亲本材料红宝石、巨玫瑰、妮娜皇后、魏可、春光、玫瑰香、中国红玫瑰、阳光玫瑰、火焰无核、红旗特早、火州黑玉、底莱特、瑰宝进行PCR扩增,初步筛选出具有差异、多态性好、扩增稳定且带型清晰的特异性引物,以便后期对葡萄杂交后代进行真实性鉴定。实验方法如下:


  (1)对13份亲本材料进行DNA提取,对其DNA质量和浓度检测;


  (28%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选 :1.制胶:在体积为50 mL8% PAGE 胶液中分别加入13.5 mL30%聚丙烯酰胺母液、10%APS 500 μL31.5 mLddH2O50 μLTEMED5 mL10×TBE。迅速混匀后立即灌胶,待胶液灌满整个玻璃板夹层后,迅速将0.4 mm 厚鲨鱼齿梳齿整齐的轻轻插入胶液。平放在桌面上,胶液在室温25℃下静置聚合1 h 以上。2.放置胶板:胶液聚合后,将胶板表面溢出的胶液清理或刮除,放置电泳槽里,将梳子两端轻轻拔出,在电泳槽里倒入1×TBE缓冲液,超过点样孔即可,槽两端电泳缓冲液的高度要没过电阻丝,电流形成通路后即可进行电泳。3.点样:在扩增后PCR产物中加入2 μL 6×Loading Buffer,混合后上样。每一个加样孔点样0.5 μL2 μL,在胶板两端点入DNA Marker4.电泳:在30 W40 W恒功率、180 v恒压下电泳约1.5 h5.取胶;6.银染:a.漂洗:在染色托盘中加入1000 mL 蒸馏水漂洗1次(约30 s),倒掉蒸馏水;b.染色:加入0.1% AgNO3 溶液,在摇床上转速30 rpm染色15 minc.漂洗:倒掉染色液至回收瓶中,用蒸馏水摇晃漂洗23次,时间约30 s,清洗干净后倒掉托盘中蒸馏水;d.显影:在染色托盘中加入显影液,迅速振动,使显影液均匀覆盖每块凝胶,然后在摇床上慢速摇动,直至显影;e.洗涤:待凝胶显影清晰后,回收显影液,加入蒸馏水至托盘中轻轻摇晃清洗凝胶2 次,直至彻底去掉显影液,以免保存凝胶时变色;f.保存:凝胶上面覆盖保鲜膜,统计带型,拍照保存。

选用40对引物对19个杂交组合的亲本进行多态性引物筛选,初筛结果如下:


  1.红宝石×巨玫瑰,多态性引物3对:VVIN52VMC1C10Vchr18a


  2.红宝石×妮娜皇后,多态性引物3对:VrZAG79VVIB66Vchr18a


  3.魏可×巨玫瑰,多态性引物3对:VVMD27VrZAG67VVIB66


  4.魏可×妮娜皇后,多态性引物3对:UDV120VVIP26VVIB66


  5.魏可×春光,多态性引物1对:VVMD27


  6.妮娜皇后×玫瑰香,多态性引物2对:VrZAG67Vchr8a


  7.中国红玫瑰×巨玫瑰、巨玫瑰×中国红玫瑰,多态性引物2对:VVS2VVIB66


  8.中国红玫瑰×妮娜皇后、妮娜皇后×中国红玫瑰,多态性引物2对:UDV120VrZAG67


  9.阳光玫瑰×巨玫瑰、巨玫瑰×阳光玫瑰,多态性引物2对:VrZAG67VMC1C10


  10.阳光玫瑰×妮娜皇后、妮娜皇后×阳光玫瑰,多态性引物4对:VVIN52VrZAG67VMC1C10Vchr3a


  11.火焰无核×红旗特早,多态性引物2对:VMC4F3-1VMC4F8


  12.底莱特×红旗特早,多态性引物8对:VVIM11VVMD32VrZAG62VrZAG93Vchr8aVchr16aVchr17aSCU06


  13.底莱特×瑰宝,多态性引物5对:VVIM11VVMD7VVII52VVIP31VMC4F8Vchr13b


  14.火州黑玉×阳光玫瑰,多态性引物8对:UDV120VVMD32VrZAG93VMC4F3-1VMC4F8VMC5G8Vchr16aVchr18a


  15.火州黑玉×中国红玫瑰,多态性引物5对:UDV120VVIM11VVII52VrZAG93SCU06