虫害防控岗位
王琦 程玉琴
葡萄是世界上极为重要的果树作物,而葡萄卷叶病(Grapevineleafroll disease,GLD)是发生在葡萄上的最重要病毒病害之一。GLD症状表现常因葡萄品种、环境条件、发病时间及年份的不同而异。一般表现是葡萄植株叶片叶缘向下反卷,而且红色葡萄品种感病后叶肉在秋季正常变红之前就变红,白色葡萄品种感病后叶色则不变红,但叶肉变黄或叶缘的颜色变浅,叶脉有轻微褪绿。该病通常可导致葡萄减产30%~50%,果实中可溶性固形物含量下降约30%。至今已发现至少有5种葡萄卷叶伴随病毒(Grapevine leafrollas soc i a t ed vi rus,GLRaV),即GLRaV-1、-2、-3、-4、-7及GLRaV-4的变种GLRaV-5, -6, -9,-De, -Pr and -Car与该病相关。许多研究结果已表明GLRaV-3是与该病相关的最重要病原物。
GLRaV-3为长线形病毒科(Closteroviridae)卷叶病毒属(Ampelovirus)的典型成员,其基因组为正单链RNA。血清学以其快速、操作简便、成本低、适合批量样品检测等优点而被广泛应用于葡萄病毒检测中。但是血清学方法的灵敏度较低,同时GLRaVs为韧皮部特异性病毒,在植株中的分布不均,且病毒在植株体内的含量随季节变化较大,因此用血清学方法检测的结果重复性较差。逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-PCR, RT-PCR)因其灵敏度高、特异性强、重复性好而成为检测GLRaVs的最常用方法。RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA(complementary DNA)的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术,其过程由两部分组成:以mRNA为模板,加入反转录引物(OligodT、随机六核苷酸引物或特异的下游引物)和dNTP,在逆转录酶的作用下,合成与mRNA互补的cDNA序列。然后以合成的cDNA为模板, 加入引物和dNTP, 在DNA聚合酶作用下进行PCR扩增。
GLRaVs的PCR检测引物通常根据病毒基因组中的相对保守蛋白基因序列如CP(coat protein)或Hsp70(70kDa-heat shock protein homolog)的保守区进行设计,反转录引物可用特异性引物,也可用随机六核苷酸引物。主要技术要点如下:
1 总RNA提取
取3-5个葡萄叶柄,用镊子剥下其外皮(韧皮部组织),混合后称取0.1~0.2g放入研钵中,加入液氮,将其研磨成粉末。将粉末转移到1.5mL离心管,按照试剂盒(EASYspin 植物 RNA 快速提取试剂盒)的操作步骤提取总RNA。用微量紫外/可见分光光度计测定RNA浓度。
2 反转录
反转录试剂盒为PrimeScript®RT reagent Kit,TaKaRa公司产品。将下列组分加入1.5 mL 离心管,混匀:将离心管放在37℃ 恒温水槽中1 小时(h)后获得cDNA。
3 PCR扩增
反转录后即进行 P C R 扩增。GLRaV- 3 检测引物( 根据GLRaV-3 Hsp70蛋白基因序列设计,正向引物GLR3-F:5'-AAGTGCTCTAGTTAAGGTCAGGAGTGA-3',反向引物GLR3-R:5'-GTATTGGACTACCTTTCGGGAAAAT- 3 ' ;浓度为2 0μM) 。用该引物检测出的目的条带大小为254bp。PCR反应体系包括下列组分:
混匀后将离心管放在PCR仪进行反应。PCR 反应条件:95℃ 预变性 5min;95℃ 变性 30s,57.0℃退火 30s,72℃ 延伸30s,40个循环;72℃ 延伸 10min。反应结束后取出。
4 琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物
(1) 制备琼脂糖凝胶溶液(浓度为1.0%):
称取琼脂糖0 . 2 g 放入三角瓶中, 将5 0 ×TAE 电泳缓冲液(2M Tris-醋酸,100mM EDTA;配制100mL:Tris 24.2g,0.5MEDTA( pH8 . 0 ) 1 0mL,冰乙酸5.7mL,去离子水定容到100mL)稀释50倍,然后将1×TAE电泳缓冲液20mL加到盛有琼脂糖 三角瓶中,盖上封口膜,振荡后置微波炉中将琼脂糖充分融化,取出后加入适量GoldViewTM核酸染料(每100mL凝胶中加入2~5 μL核酸染料)并轻摇混匀。
(2)凝胶的制备:将凝胶板置于制胶架中,插上加样梳,待胶溶液冷却至50℃左右时,轻轻倒入凝胶板上,除掉气泡。待凝胶冷却凝固后,垂直轻轻拔出梳子后将凝胶放入电泳槽内,加入1×TAE电泳缓冲液,使电泳缓冲液的液面略高出琼脂糖凝胶面。
(3) 加样: 在薄膜上混合PCR产物(5μL,约0.5~1μg)和上样缓冲液(1μL)。用微量移液器分别将样品和DNA Marker加入琼脂糖凝胶的加样孔内,每加完一个样品,应更换一个Tip头,以防污染,加样时勿碰坏加样孔周围的凝胶。注意:加样前要先记下加样的顺序。
(4)电泳:加样后,将电泳槽立即通电进行电泳,调节到合适电压(5 V/cm)。当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1 cm处时,停止电泳。
(5) 观察和拍照: 电泳完毕,取出凝胶。在凝胶成像仪下观察是否出现目的条带(约254 bp)并拍照。