果实病害防控岗位
葡萄斑点病(grapevine fleckdisease)在世界各地普遍发生。该病常导致葡萄叶片出现黄色斑块或斑点、叶片皱缩、扭曲、向上反卷。葡萄斑点病毒(Grapevine fleckvirus ,GFkV)是与该病相关的病原物。GFkV为芜菁黄花叶病毒科family Tymoviridae )葡萄斑点病毒属(gneus Maculavirus )成员。我国行业标准“NY/T1843-2010葡萄无病毒母本树和苗木”规定该病毒是应检对象。我们建立了GFkV的RT-PCR检测方法,可以简单、快速和经济地检测该病毒。
1 实验材料、试剂与用具
1.1 植物材料
葡萄叶柄。
1.2 试剂和仪器
E A S Y s p i n 植物 RNA 快速提取试剂盒、反转录试剂盒(PrimeScript® RT reagent Kit,TaKaRa)、TaKaRa TaqTM DNA 聚合酶、dNTP Mixture (2.5mMe a c h ) 、双蒸水(ddH2O) 、50×TAE 电泳缓冲液(2M Tris-醋酸,100mM EDTA;配制100 mL:Tris 24.2 g,0.5 M EDTA(PH8.0)10mL,冰乙酸 5.7mL,去离子水定容到100mL。电泳时将其稀释50倍)、液氮、GoldViewTM 核酸染料、DNA分子量大小(DL2000DNA Marker)及其附带的DNA电泳上样缓冲液( 6 ×Load ingBuffer)。
PCR仪、微量台式冷冻离心机、电热恒温水槽、涡旋混合器、微量紫外/可见分光光度计、微波炉、天平、凝胶成像仪、灭菌锅、移液器、电泳仪、水平电泳槽、制胶架、凝胶板、加样梳、烧杯、量筒、玻璃棒、研钵、1.5 mL离心管、0.2 mL离心管、Tip头、一次性手套和口罩、研钵。
1.3 检测引物
正向引物C P - F :5′-GTGTAAGCATCCATCTCCCCTTCCAG -3′
反向引物C P - R :5′-GAGTCGATGGTCCAGCAGAGGTC′。
PCR扩增产物是GFkV的CP基因部分序列,长度210bp。
2 实验方法
2.1 总RNA提取
取3-5个叶柄,用镊子剥下其外皮(韧皮部组织),混合后称取0.1 g~0.2 g放入研钵中,加入液氮,将其研磨成粉末。将粉末转移到1.5 mL离心管,按照EASYspin植物 RNA 快速提取试剂盒的操作步骤提取总RNA。用微量紫外/可见分光光度计测定RNA浓度。
2.2 反转录
将反转录试剂盒(PrimeScript®RT reagent Kit, TaKaRa)中组分及提取的RNA按表所示加入1.5 mL 离心管,混匀:

将离心管放在42℃ 恒温水槽中1 小时(h)后获得cDNA。
2.3 PCR扩增
反转录后即进行 PCR 扩增,在 0.2mL 离心管中加入下列组分:

混匀后将离心管放在PCR仪进行反应。PCR 反应条件:95℃预变性5 min;95℃变性 20s,63.0℃退火30 s,72℃延伸20s,35个循环;72℃ 延伸5min。反应结束后取出。
2.4 琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物
(1) 制备琼脂糖凝胶溶液(浓度为1.0%) : 称取琼脂糖0.2g,加入1 ×TAE电泳缓冲液20mL,盖上封口膜,振荡后置微波炉中将琼脂糖充分融化,取出后加入适量GoldViewTM核酸染料(每100mL凝胶中加入2~5μL核酸染料)并轻摇混匀。
(2)凝胶的制备:将凝胶板置于制胶架中,插上加样梳,待胶溶液冷却至50℃左右时,轻轻倒入凝胶板上,除掉气泡。待凝胶冷却凝固后,垂直轻轻拔出梳子后将凝胶放入电泳槽内,加入1×TAE电泳缓冲液,使电泳缓冲液的液面略高出琼脂糖凝胶面。
(3) 加样: 在薄膜上混合PCR产物(5μL,约0.5~1μg)和上样缓冲液(1μL)。用微量移液器分别将样品和DNA Marker加入琼脂糖凝胶的加样孔内,每加完一个样品,应更换一个Tip头,以防污染,加样时勿碰坏加样孔周围的凝胶。注意:加样前要先记下加样的顺序。
(4)电泳:加样后,将电泳槽立即通电进行电泳,调节到合适电压(5V/cm)。当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳。
(5) 观察和拍照: 电泳完毕,取出凝胶。在凝胶成像仪下观察是否出现目的条带(约210bp)并拍照。如果有目的条带,说明样品中很可能感染了GFkV。